Hospitalizace při anorexii je nezbytná, když tělo selhává a ambulantní léčba nestačí. V ČR se provádí pouze v jednom specializovaném centru. Základním kritériem je BMI pod 17,5, váhový úbytek více než 25 % a psychický stav pacientky. Délka hospitalizace je průměrně 41 dní.